El descubrimiento y desarrollo de medicamentos cada vez más efectivos, seguros y adecuados en el tratamiento de enfermedades, es una tarea que requiere del esfuerzo coordinado e inteligente de un elevado números de profesionales de distinta formación científica; es una tarea de carácter interdisciplinaria.
El cómputo científico aplicado a las ciencias básicas no ha sido ajeno al avance de la investigación farmacéutica. Desde el surgimiento del diseño de fármacos asistido por computador (DiFAC) en los años setenta, el uso de métodos computacionales aplicados al descubrimiento de fármacos ha estado en continuo crecimiento y desarrollo. El DiFAC junto con el análisis de extensas librerías de compuestos orgánicos de origen sintético y natural han acelerado el proceso de descubrimiento de los fármacos. Por esta razón, el DiFAC se constituye un instrumento indispensable en el desarrollo de nuevas medicinas, incrementando las posibilidades de éxito y disminuyendo el tiempo y costo de investigación.
El DiFAC, como método de diseño racional de fármacos, usa la información experimental disponible para generar modelos computacionales y así comprender las relaciones estructura-actividad biológica que tienen los fármacos. Estos modelos permiten comprender que tipo requerimientos estructurales deben tener las moléculas para mostrar actividad biológica, diseñar nuevas moléculas potencialmente activas, y predecir la actividad biológica de moléculas experimentales o virtuales.